Amenazas
El agua, líquido vital de la tierra, se encuentra día a día expuesto a una serie de amenazas que afectan la amplia variedad de ecosistemas en la ecorregión. Es por esta razón que el Fondo Mundial para la Naturaleza (WWF, por sus siglas en inglés) trabaja en la prevención de la contaminación de aguas en las ecorregiones prioritarias del Arrecife Mesoamericano.
Uno de los grandes problemas en el Arrecife Mesoamericano (MAR,por sus siglas en inglés) es la contaminación de las aguas provocada por los desechos de los barcos, además del peligro de derrames y los residuos de pesticidas, desechos urbanos e industriales y fertilizantes utilizados en las actividades productivas, que van a parar a los afluentes y finalmente al océano.La deforestación también contribuye a sedimentar las aguas que desembocan en la costa y eso constituye un gran peligro para los corales, ya que lo cubren, evitando que éste realice su labor de fotosíntesis y, por ende, muere. La contaminación de las aguas tambíén afecta la actividad pesquera y las especies asociadas al coral.
Es por eso que la calidad del agua es otro punto medular de la labor que desarrolla WWF en la Ecorregión del Arrecife Mesoamericano. No solo se busca generar diagnósticos de impactos y monitoreo de la calidad del agua, sino también llevar a cabo un proceso de acercamiento con la agroindustria, a fin de que ésta se convenza de la importancia de desarrollar mejores prácticas de manejo como parte de un ordenamiento del desarrollo costero que beneficie a todos los actores involucrados.